El instituto Mediterráneo ha sido seleccionado recientemente para participar en el programa «Andalucía Profundiza». El citado programa es puesto en marcha por la Consejería de Educación de la Junta de Andalucía para la profundización de conocimientos. Con este programa se pretende potenciar el interés del alumnado por la ciencia y por la investigación, convirtiéndolos en agentes activos en la construcción de sus aprendizajes. Para que un centro pueda concurrir a «Andalucía Profundiza» ha de contar con un «profesorado destacado por sus buenas prácticas y su trayectoria en la aplicación de la investigación al aula, así como en el acercamiento del mundo científico al alumnado».  En concreto, el centro participa con dos proyectos, «Invasores entre nosotros» (Ciencias Naturales) y «Bioart» (Educación Plástica y Visual), dirigidos por Antonio M. Escámez Pastrana y Francisco J. Melgá Mesa respectivamente.